Work Experience

  • Todate 2014

    Yrd. Doç. Dr.

    Erciyes Üniversitesi, Bilgisayar Mühendisliği

  • 2013 2012

    Research Assistant Professor

    University of Nebraska-Lincoln, Electrical engineering

  • 2012 2011

    Postdoctoral Associate

    University of Nebraska-Lincoln, Electrical engineering

  • 2011 2011

    Ögr.Gör.

    University of Nebraska-Lincol, Electrical Engineering

  • 2011 2005

    Arş.Gör

    University of Nebraska-Lincoln, Electrical Engineering

Education & Training

  • Ph.D. 2011

    Electrical Engineering

    University of Nebraska Lincoln

  • Master...

    -

    -

  • Bachelor2004

    Elektrik elektronik Müh.

    Boğaziçi Üniversitesi

Honors, Awards and Grants

Research Projects

  • image

    "Nanogözenek DNA Dizilemesi İle Hızlı Patojen Tanıma Yapabilen Algoritmaların Geliştirilmesi", TÜBITAK Projesi, 116S083, Yönetici, Devam Ediyor

  • image

    "Kolistin Dirençli Gram-Negatif Patojenlerde Direnç Kazanım Paternlerinin Tüm Genom Dizi Analizleri İle Ortaya Çıkarılması", TÜBITAK Projesi, 315S263, Danışman, Devam Ediyor

  • image

    " ATD: Algorithms for the analysis of microbiomes", Diğer Projeler, NSF:1043089, Yönetici, 2014

  • image

    "Alzheimer hastalığı ile intestinal mikrobiyomun potansiyel ilişkisinin metagenomik analizlerle değerlendirilmesi", TÜBITAK Projesi, 215S707, Araştırmacı, Devam Ediyor

  • image

    "Parkinson Demansinin Erken Teşhisinde Kullanilabilecek İnvaziv Olmayan, Yenilikçi Ve Kombinatoryal Biyobelirteçler", TÜBITAK Projesi, 315S301, Araştırmacı, Devam Ediyor

  • image

    "Yoğunbakım Ünitelerinde Mikrobiyom Bulaş Ağının Çıkarımı İçin Hesaplamalı Kaynak İzsürümü Yöntemlerinin Araştırılması ve Geliştirilmesi", TÜBITAK Projesi, 115E998, Yönetici, Devam Ediyor

  • image

    "Identification of Biological Materials of Unknown Origin", Diğer Projeler, 5K25AI068151, Araştırmacı, 2012

  • image

    "Hastane ve kentsel atık/arıtılmış su metagenomunda de nova mikrobiyal çeşitlilik rezistom virülom ve mobilom analizlerinin yapılması", BAP Diğer, TCD-2016-6041, Araştırmacı, Devam Ediyor

Filter by type:

Sort by year:

-

Original Article -, Volume -, Issue -, 2000, Pages -

Abstract

-


Özet

Nalbantoğlu Ö.U., Way S.F., Hinrichs S.H., Sayood K., "Raiphy: Phylogenetic Classification Of Metagenomics Samples Using Iterative Refinement Of Relative Abundance Index Profiles", BMC BIOINFORMATICS, vol.12, 2011

-

Original Article -, Volume -, Issue -, 2000, Pages -

Abstract

-


Özet

Larson M., Nalbantoğlu Ö.U., Sayood K., Zentz E.B. , Dempsey M.P., Fey P.D., et al., "Francisella tularensis Subtype A.II Genomic Plasticity in Comparison with Subtype A.I", PLOS ONE, vol.10, pp.10.4-10.4, 2015

-

Original Article -, Volume -, Issue -, 2000, Pages -

Abstract

-


Özet

Nalbantoğlu Ö.U., Sayood K., Dempsey M.P., Iwen P.C., Francesconi S.C., Barabote R.D., Xie G., Brettin T.S., Hinrichs S.H., Fey P.D., "Large Direct Repeats Flank Genomic Rearrangements Between A New Clinical Isolate Of Francisella Tularensis Subsp Tularensis A1 And Schu S4", PLOS ONE, vol.5, 2010

-

Original Article -, Volume -, Issue -, 2000, Pages -

Abstract

-


Özet

Nalbantoğlu Ö.U., Russell D.J., Sayood K., "Data Compression Concepts And Algorithms And Their Applications To Bioinformatics", ENTROPY, vol.12, pp.34-52, 2010

-

Original Article -, Volume -, Issue -, 2000, Pages -

Abstract

-


Özet

Nalbantoğlu Ö.U., Cakar A., Dogan H., Abaci N., Ustek D., Sayood K., Can H., "Metagenomic Analysis Of The Microbial Community In Kefir Grains", FOOD MICROBIOLOGY, vol.41, pp.42-51, 2014

Currrent Teaching

Teaching History

  • 2016 GÜZ

    BIOINFORMATICS

    Ders öğrencilerin alandaki önemli bilgilere hakim olmasını ve araçları etkin bir şekilde kullanabilmelerini hedeflemektedir.

At My Office